ICS 65.020.30 CCS B43 43 湖南省地方 标准 DB 43/T 3044—2024 猪基因组选择育种技术规程 Technical code of genomic selection in pig breeding 2024 - 08 - 30发布 2024 - 11 - 30实施 湖南省市场监督管理局 发布 DB 43/T 3044— 2024 I 目次 前言 ................................................................................. II 1 范围 ............................................................................... 1 2 规范性引用文件 ..................................................................... 1 3 术语和定义 ......................................................................... 1 4 操作步骤要求 ....................................................................... 2 参考群建立 ..................................................................... 2 表型测定 ....................................................................... 2 基因型检测 ..................................................................... 2 预测模型构建 ................................................................... 2 候选个体遗传评估及选留 ......................................................... 2 5 档案管理 ........................................................................... 3 DB 43/T 3044— 2024 II 前言 本文件按照 GB/T 1.1 —2020《标准化工作导则 第1部分：标准化文件的结构和起草规则》的规定 起草。 请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任 。 本文件由湖南省农业农村厅 提出。 本文件由湖南省农业标准化技术委员会 归口。 本文件起草单位：湖南农业大学、 长沙市农业综合行政执法局、 湖南新五丰股份有限公司 。 本文件主要起草人： 何俊、张跃博、杨芳、高宁、杨彦达、李熙、汪加明、刘正祥。 DB 43/T 3044— 2024 1 猪基因组选择育种技术规程 1 范围 本文件规定了猪基因组选择育种技术的操作步骤要求和档案管理。 本文件适用于猪基因组选择育种，其他畜禽品种也可参照使用。 2 规范性引用文件 下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。 其中， 注日期的引用文件， 仅该日期对应的版本适用于本文件；不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改单）适用于本 文件。 GB/T 2773 宁乡猪 GB/T 22283 长白猪种猪 GB/T 22284 大约克夏猪种猪 GB/T 22285 杜洛克猪种猪 GB 23238 种猪常温精液 GB/T 24697 湘西黑猪 GB/T 31016 移动实验室样品采集与处理通用技术规范 GB/T 32759 瘦肉型猪活体质量评定 GB/T 40184 畜禽基因组选择育种技术规程 NY/T 821 猪肌肉品质测定技术规范 NY/T 822 种猪生产性能测定规程 NY/T 825 瘦肉型猪胴体性状测定技术规范 NY/T 1673 畜禽微卫星 DNA遗传多样性检测技术规程 NY/T 2826 沙子岭猪 NY/T 2894 猪活体背膘厚和眼肌面积的测定 DB43/T 526 黔邵花猪 DB43/T 1193 沙子岭猪生产性能测定技术规程 3 术语和定义 下列术语和定义适用于本文件。 基因组选择 genomic selection 利用覆盖全基因组的高密度单核苷酸多态性遗传标记，结合表型记录和系谱信息估计或预测猪个 体基因组育种值，从而实现个体遗传评估和选择的方法。 参考群 reference population 由遗传背景相近、基因组信息 和表型记录完整的个体 所组成的群体。 DB 43/T 3044— 2024 2 候选群 candidate population 由具有基因组分型信息，没有或仅有少量表型记录， 需利用参考群 信息预测其基因组育种值、 从中 选出留种对象 的个体构成的群体。 4 操作步骤要求 参考群建立 4.1.1 群体规模 根据待选猪种和目标性状，选择不少于 1000头的核心群个体。 4.1.2 群体结构 选择与候选群具有亲缘关系且具有群体代表性的个体构建参考群。 表型测定 —— 瘦肉型猪活体质量的测定按照 GB/T 32759 的要求执行； —— 猪活体背膘厚和眼肌面积的测定按照 NY/T 2894 的规定进行； —— 猪肌肉品质测定的指标、方法和条件按照 NY/T 821 的规定执行； —— 瘦肉型猪胴体性状测定的方法按照 NY/T 825 的规定执行； —— 湖南地方猪沙子岭猪性能测定的方法按照 DB43/T 1193 执行； —— 种猪生产性能测定中心的基本测定条件，受测猪的选择，测定项目、方法及结果的评定方法 按照NY/T 822 的要求执行。 基因型检测 4.3.1 采样 采集血液、尾巴、耳朵、毛囊或精液等生物样品；采集样品时，应避免个体间 DNA交叉污染；相关 操作应符合 GB/T 31016 规定。 4.3.2 DNA提取 DNA的提取按照 NY/T 1673 的规定执行。所提取的 DNA样本应符合基因芯片或测序对样品质量和数 量的要求。 4.3.3 基因组分型 采用基因芯片或 DNA测序等方法进行基因组分型。 预测模型构建 根据采集的表型和基因组分型信息，选取可最大化利用群体信息且育种值估计准确性最高的 BLUP、 贝叶斯或机器学习等估测方法，建立基因组育种值预测模型。 候选个体遗传评估及选留 4.5.1 候选个体确定