ICS 11.220 B 41 DB34 安 徽 省 地 方 标 准 DB 34/T 1940—2013 鸡传染性喉气管炎 PCR 检测技术规程 Technical regulation for detection of Chicken Infectious Laryngotracheitis by PCR 2013 - 08 - 28 发布 安徽省质量技术监督局 2013 - 09 - 28 实施 发 布 DB34/T 1940—2013 前 言 本标准按照 GB/T 1.1-2009 给出的规则起草。 本标准由安徽省农业委员会提出。 本标准起草单位:安徽农业大学动物科技学院、安徽省动物疫病预防与控制中心。 本标准主要起草人: 王桂军、朱良强、耿照玉、占松鹤、汪彤、江定丰、魏建忠、潘玲、陈静、何 长生、杨德康、栗新、吴保谊。 I DB34/T 1940—2013 鸡传染性喉气管炎 PCR 检测技术规程 1 范围 本标准规定了应用聚合酶链反应(PCR)方法检测鸡传染性喉气管炎,包括样品的采集、样品处理、 试验材料、操作程序和结果判定等。 本标准适用于临床鸡传染性喉气管炎的检测和诊断。 2 试验材料 2.1 特异性引物 根据 ILTV 的 TK 基因序列设计了一对引物,序列为:上游引物 A1: 5'- GGG AAA CTT GAA TGT CGG GAG-3', 下游引物 A2: 5'- TGG ATT ATA CGC CGT GCC TGT -3',扩增 DNA 片段大小为 329 bp,引 物的使用浓度为 50 mmol/L。 2.2 试剂 2.2.1 DNA 提取试剂 DNA 提取试剂如下: ——消化缓冲液: 10 mmol/L Tris-Cl,pH 8.0; 0.1 mmol/L EDTA,pH 8.0; 10% SDS; ——20 mg/Ml 蛋白酶 K; ——苯酚; ——氯仿; ——无水乙醇; ——75%乙醇; 2.2.2 PCR 试剂 PCR 试剂如下: ——2×Taq PCR MsaterMix 试剂; ——特异性引物; ——阳性对照:ILT 活疫苗(含鸡传染性喉气管炎 K317 株病毒) 2.2.3 电泳试剂 电泳试剂如下: ——溴化乙锭; ——琼脂糖:电泳级; 1 DB34/T 1940—2013 ——电泳缓冲液 2.2.4 其他试剂 其他试剂如下: ——灭菌双蒸水; ——1 mol/L(灭菌)PBS:pH 7.2。 2.3 仪器设备及耗材 2.3.1 仪器设备 本方法使用下列仪器设备: ——PCR 仪; ——电泳仪; ——电泳槽; ——紫外光透射仪; ——凝胶成像系统; ——小型高速离心机; ——水浴锅; ——旋涡振荡器; ——乳钵或玻璃研磨器; ——微量加样器:100 µL~1000 µL、20 µL~200 µL、5 µL~50 µL 和 1 µL~10 µL 等多种规格。 2.3.2 一次性耗材 本方法使用下列一次性耗材: ——离心管(PP 材质):1.5 mL; ——PCR 反应管(PP 材质):0.2 mL; ——吸头:1 000 µL、200 µL、10 µL 等多种规格。 3 操作程序 3.1 喉头、气管组织样品的处理 无菌采取发病鸡的喉头、器官组织样品,置于灭菌乳钵中剪碎,充分研磨,用灭菌 PBS 溶液配成 1 ︰5 乳悬液,反复冻融 3 次。以 5 000r/min 离心 5 min,收集上清液,供 DNA 提取或置 -20℃保存 备用。 3.2 待检样品 DNA 提取 3.2.1 喉头、气管组织样品 DNA 提取 取处理好的样品 250 µL 于 1.5 mL 离心管中,每管加 400 µL 消化缓冲液(500 mmol/L Tris, 20 mmol/L EDTA,10 mmol/L NaCl,1% SDS),加蛋白酶 K 至终浓度 100 µg/mL,混匀;50℃水浴 1 h。从水浴中取出消化后样品,每管加入饱和苯酚 600 µL,充分震荡摇匀,12000 r/min 离心 10 min; 取上清液约 400 µL,分别加入 200 µL 饱和苯酚和 200 µL 氯仿溶液,震荡摇匀,12000 r/min 离心 10 min;取上清液再加入 2.5 倍体积无水乙醇,摇匀后置 -20℃沉淀 30 min;10000 r/min 离心 10 min, 2 DB34/T 1940—2013 弃去上清液,加入 1 mL 75%的酒精洗涤沉淀一次,将所得核酸沉淀物放在 42℃烘箱内烘干或室温放 置自然晾干;每管中加入 30 µL TE 或灭菌双蒸水。获得的DNA 样品可直接进行 PCR 反应或置 -20℃ 保存备用。 3.3 PCR 检测 在冰浴条件下,按下列试剂用量在 PCR 反应管中分别加入各成分: ——2×PCRTaqMix 酶 12.5 µL ——50 mmol/LILV 检测上下游引物(A1 和 A2):各 1 µL,终浓度为 1 mmol/L; ——待检样品 DNA:5 µL; ——灭菌双蒸水:补足至总体积为 25 µL。加完试剂后瞬时离心混匀。将 PCR 反应管置于 PCR 仪 内,按如下程序进行 PCR 反应:94℃预变性 3 min 后,进入循环 94℃变性 15 s, 53℃退火 30 s, 72℃延伸 30 s, 30 个循环后, 72℃延伸 10 min。PCR 产物可直接进行琼脂糖凝胶电泳分 析或置 4℃保存备用。 3.4 阳性及阴性对照 3.4.1 阳性对照 用 ILT 活疫苗(含鸡传染性喉气管炎 K317 株病毒)作为阳性对照。 3.4.2 阴性对照 用灭菌双蒸水作为阴性对照。 3.5 电泳 3.5.1 3.5.2 3.5.3 3.5.4 3.5.5 3.5.6 4 制备 1.0%琼脂糖凝胶板。 取 5μL PCR 产物,与 0.5μL 加样缓冲液混合,加入琼脂糖凝胶板的加样孔中。 加入分子量标准 DNA Marker。 盖好电泳仪,插好电极,将电压调至 90V 左右电泳,30~40min。 取出凝胶,置于紫外凝胶成像仪系统扫描、拍照。 以 DNA Marker 为参照分子量标准,判断 PCR 扩增片段大小。 结果判定 将电泳后的琼脂糖凝胶置于紫外光透射仪上观察,与标准 DNA 分子量比较,分析结果,然后可用 凝胶成像系统拍照保存。若待检样品在 329 bp 左右的位置出现一条特异性 DNA 条带,且与阳性对照 的 DNA 条带位置一致,则判定为鸡传染性喉气管炎阳性。 A _________________________________ 3
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