(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 20221082483 0.0 (22)申请日 2022.06.28 (71)申请人 厦门艾德生物医药 科技股份有限公 司 地址 361000 福建省厦门市海沧区鼎山路 39号 (72)发明人 洪强　金保雷　殷子强　傅烨霖　 赵静波　董华　郑方克　罗捷敏　 郑立谋　 (74)专利代理 机构 厦门市首创君 合专利事务所 有限公司 3 5204 专利代理师 姜谧 (51)Int.Cl. C12Q 1/6886(2018.01) C12N 15/11(2006.01)C12Q 1/6869(2018.01) (54)发明名称 一种基于高通量测序的髓系白血病基因突 变检测的探 针引物组及其应用 (57)摘要 本发明公开了一种基于高通量测序的髓系 白血病基因突变检测的探针引物组， 包括DNA探 针组、 RNA探针组和RNA反转录引物组。 本发明能 够在单管内同时检测单个样本中10至53个基因 的SNV， InDel， Fusion； 检测性能好， 特异性高于 现有捕获法技术同时探针均一性又高于多重PCR 技术； 价格 更低可操作性更 强， DNA与RNA在1管内 共检测体系， 降低实验的成本， 缩短实验步骤。 权利要求书2页 说明书47页 序列表281页 附图2页 CN 115141886 A 2022.10.04 CN 115141886 A 1.一种基于高通量测序的髓系白血病基因突变检测的探针引物组， 其特征在于： 包括 DNA探针组、 RNA探针组和RNA反转录引物组， 其中， DNA探针组包括如SEQ  ID NO.0059至0066、 SEQ  ID NO.0102至0 131、 SEQ ID NO.0158至 0172、 SEQ  ID NO.0244至0280、 SEQ  ID NO.0285至0293、 SEQ  ID NO.0520至0625和SEQ  ID  NO.0821至 0836所示的序列， 且该DNA探针组中的序列 均磷酸化； RNA探针组包括如SEQ  ID NO.1077、 SEQ  ID NO.1082至1168、 SEQ  ID NO.1170至1171、 SEQ ID NO.1174、 SEQ  ID NO.1176、 SEQ  ID NO.1184至1186、 SEQ  ID NO.1188至1198、 SEQ   ID NO.1201、 SEQ  ID NO.1203至1221、 SEQ  ID NO.1234至1238、 SEQ  ID NO.1249至1252、 SEQ   ID NO.1266、 SEQ  ID NO.1271至1357、 SEQ  ID NO.1359至1360、 SEQ  ID NO.1363、 SEQ  ID  NO.1365、 SEQ  ID NO.1373至1375、 SEQ  ID NO.1377至1387、 SEQ  ID NO.1390、 SEQ  ID  NO.1392至1410、 SEQ  ID NO.1423至1427和SEQ  ID NO.1438至1441所示的序列； SEQ  ID  NO.1077、 SEQ  ID NO.1082至1168、 SEQ  ID NO.1170至1171、 SEQ  ID NO.1174、 SEQ  ID  NO.1176、 SEQ  ID NO.1184至1186、 SEQ  ID NO.1188至1198、 SEQ  ID NO.1201、 SEQ  ID  NO.1203至1221、 SEQ  ID NO.1234至1238和SEQ ID NO.1249至1252所示的序列中， 从5 ’端开 始的六个核苷酸均有硫代修饰； SEQ  ID NO.1266、 SEQ ID NO.1271至1357、 SEQ ID NO.1359 至1360、 SEQ  ID NO.1363、 SEQ  ID NO.1365、 SEQ  ID NO.1373至1375、 SEQ  ID NO.1377至 1387、 SEQ  ID NO.1390、 SEQ  ID NO.1392至1410、 SEQ  ID NO.1423至1427和SEQ  ID NO.1438 至1441所示的序列 均磷酸化， 且从3 ’端开始的六个核苷酸均有硫代修饰； RNA反转录引物组包括如SEQ  ID NO.1455、 SEQ  ID NO.1460至 1546、 SEQ  ID NO.1548至 1549、 SEQ  ID NO.1552、 SEQ  ID NO.1554、 SEQ  ID NO.1562至1564、 SEQ  ID NO.1566至1576、 SEQ ID NO.1579、 SEQ  ID NO.1581至1599、 SEQ  ID NO.1612至1616和SEQ  ID NO.1627至 1630所示的序列。 2.如权利要求1所述的探针引物组， 其特 征在于： 所述DNA探针组包括如SEQ  ID NO.0001至0008、 SEQ  ID NO.0059至0082、 SEQ  ID  NO.0102至0131、 SEQ  ID NO.0158至0172、 SEQ  ID NO.0184至0280、 SEQ  ID NO.0285至0293、 SEQ ID NO.0296至0302、 SEQ  ID NO.0346至0351、 SEQ  ID NO.0355至0459、 SEQ  ID NO.0520 至0640、 SEQ  ID NO.0692至0836、 SEQ  ID NO.0850至1001和SEQ  ID NO.1026至1074所示的 序列， 且该DNA探针组中的序列 均磷酸化； 所述RNA探针组包括如SEQ  ID NO.1075至1252和SEQ  ID NO.1264至1441所示的序列； SEQ ID NO.1075至1252所示的序列中， 从5 ’端开始的六个核苷酸均有硫代修饰； SEQ  ID  NO.1264至14 41所示的序列 均磷酸化， 且从3 ’端开始的六个核苷酸均有硫代修饰； 所述RNA反转录引物组包括如SEQ  ID NO.1453至1630所示的序列。 3.如权利要求2所述的 的探针引物组， 其特 征在于： 所述DNA探针组包括如SEQ  ID NO.0001至1074所示的序列， 且SEQ  ID NO.0001至1074 所示序列 均磷酸化； 所述RNA探针组包括如SEQ  ID NO.1075至1452所示的序列； SEQ  ID NO.1075至1263所 示的序列中， 从5 ’端开始的六个核苷酸均有硫代修饰； SEQ  ID NO.1264至1452所示的序列 均磷酸化， 且从3 ’端开始的六个核苷酸均有硫代修饰； 所述RNA反转录引物组包括如SEQ  ID NO.1453至1641所示的序列。权　利　要　求　书 1/2 页 2 CN 115141886 A 24.如权利要求1至3中任一权利要求所述的探针引物组， 其特征在于： 由所述DNA探针 组、 RNA探针组和RNA反转录引物组 组成。 5.如权利要求4所述的探针引物组， 其特征在于： 所述DNA探针组由如SEQ  ID NO.0001 至1074所示的序列组成。 6.如权利要求4所述的探针引物组， 其特征在于： 所述RNA探针组由如SEQ  ID NO.1075 至1452所示的序列组成。 7.如权利要求4所述的探针引物组， 其特征在于： RNA反转录引物组由如SEQ  ID  NO.1453至1641所示的序列组成。 8.如权利要求4所述的探针引物组， 其特征在于： 所述DNA探针组由如SEQ  ID NO.0001 至1074所示的序列组成， 所述RNA探针组 由如SEQ ID NO.1075至1452所示的序列组成， RNA 反转录引物组由如SEQ  ID NO.1453至1641所示的序列组成。 9.一种基于高通量测序的髓系白血病基因突变检测试剂盒， 其特征在于： 具有权利要 求1至8中任一权利要求所述的探针引物组。 10.权利要求1至8中任一权利要求所述的探针引物组在制备基于 高通量测序的髓系白 血病基因突变 检测试剂盒中的应用。权　利　要　求　书 2/2 页 3 CN 115141886 A 3