(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210607760.3 (22)申请日 2022.05.31 (71)申请人 西安交通大 学 地址 710049 陕西省西安市碑林区咸宁西 路28号 (72)发明人 李辰　娄沛良　王春宝　高泽宇　 龚铁梁　 (74)专利代理 机构 西安智大知识产权代理事务 所 61215 专利代理师 季海菊 (51)Int.Cl. G06F 16/36(2019.01) G06F 40/30(2020.01) G06V 20/69(2022.01) (54)发明名称 基于语义网技术的组织病理切片语义描述 语言的建立及应用方法 (57)摘要 一种基于语义网技术的组织病理切片语义 描述语言的建立及应用方法， 其中语义描述语言 的建立为： 通过建立病理特征描述语言的基本 项， 包括本体类、 对象属性与数据属性， 能够表示 病理切片中的更大范围的病理特征； 在应用上， 对组成该表型的的每一个实体、 实体的属性、 实 体之间的关系进行细粒度描述， 相较现有工作， 能够大大降低表示的歧义性， 另外， 结合网络本 体语言(OWL)自身具备的检索、 推理等功能， 能够 进一步降低计算机传输、 理解、 分析复杂病理特 征的难度； 本发 明能够对不同癌种的病理切片中 出现的多元病理特征进行描述， 实现对病理特征 更加完整、 精确的表示， 为实现病理数据语义互 操作性提供基础技 术支撑。 权利要求书5页 说明书11页 附图3页 CN 114896419 A 2022.08.12 CN 114896419 A 1.一种基于语义网技术的组织病理切片语义描述语言的建立方法， 其特征在于： 基于 网络本体语言OWL， 采用本体编辑工具Prot égé‑OWLeditor， 建立病理特征描述语言的基本 项， 包括本体类、 对象属性与数据属性； 其中， 本体类用于表达相关概念， 对象属性用于描述 本体类之间的逻辑关系， 而数据属性用来存 储名称、 数值 等信息。 2.根据权利要求1所述的一种基于语义网技术的组织病理切片语义描述语言的建立方 法， 其特征在于： 具体包括以下步骤： 一、 构建本体 类所属分支； 二、 设置对象属性， 在本体类中使用对象属性， 通过设置属性值为其他类， 表示该类与 其他类之间的关系： 设置对象属性要定义属性域domain和范围range， 定义对象属性属性域 domain， 即规定哪些本体类可以使用该对象属性； 定义对象属性属性范围r ange， 即规定哪 些本体类可作为该属性的属性 值； 三、 设置数据属性， 在本体类中使用数据属性， 定义数据属性的属性域domain指规定哪 些本体类可以使用该数据属性； 定义数据属性的属性范围range指明确属性值的数据类型， 包括字符、 数值 等。 3.根据权利要求2所述的一种基于语义网技术的组织病理切片语义描述语言的建立方 法， 其特征在于： 所述 步骤一具体包括： Step1将本体类分为Entity类、 Utility类， Entity用于表示病理表型， Utility类用于 辅助表示Entity类； Step2对Entity类设置Phenotype、 PhysicalEntity子类， 令Phenotype用于表示病理切 片中的病理表型， Ph ysicalEntity用于表 示组成病理表型的实体， 包括细胞， 细胞的组成结 构包括细胞质、 细胞核、 核仁等， 细胞的化学物质包括细胞的产物或储存物等， 组织及相关 的解剖学 结构包括管或腔等； Step3将Step2中的PhysicalEntity分为Substance、 NormalEntity与Tumor子类， 令 Substance用于表示病理切片中出现的化学物质， NormalEntity用于表示病理切片中出现 的非癌变实体， T umor用于表示病理切片中出现的癌变实体； Step4将Step3中的NormalEntity进一步分为Norm alCell、 Norm alCellularComponent、 NormalAna tomicalEntity子类 ， 令NormalCel 用于表示非 癌变细胞 ， NormalCellularComponent用于表示非癌 变细胞组成成分， NormalAnatomicalEntity用于 表示非癌变的组织或解剖学 结构； Step5将Step3中的Tumor进一步分为Parenchyma与Stroma子类， 令Parenchyma用于表 示肿瘤的实质， St roma用于表示肿瘤的间质； S t e p 6 将 S t e p 5 中 的 P a r e n c h y m a 进 一 步 分 为 N e o p l a s t i c C e l l 、 NeoplasticCellular Component、 ParenchymaAnato micalEntity子类， 令NeoplasticCell用 于表示肿瘤细胞， NeoplasticCellularComponent用于表示肿瘤细胞的组成成分， ParenchymaAnatomicalEntity用于表示肿瘤组织内部形成的解剖学 结构； Step7将Step5中的Stroma进一步分为StromaCell、 StromaCellularComponent与 StromaAnatomicalEntity子类 ， 令StromaCell表示肿瘤间 质的细胞 ， StromaCellularComponent表示肿瘤间质的组成成分， StromaAnatomicalEntity表示因肿 瘤发生发展 而增生形成的组织或解剖学 结构；权　利　要　求　书 1/5 页 2 CN 114896419 A 2Step8将Step2中的Phenotype分为Cellular_Appearances、 Pro duct_or_Reserve以及 Architectural_Pattern子类， 令Cellul ar_Appearances用于表示细 胞表型， Product_or_ Reserve用于表示细胞产物与储存物构成的表型， Architectural_Pattern用于表示结构表 型； Step9将Step1中的Utility类分为EntityReference、 EntityAttribute、 Quantification、 Relation ship； 令EntityReferenc e用于表示组成病理表型的实体的实体 类型， 包括细胞种类、 组织类型等； 令EntityAttribute用于表示实体的特征， 包括大小、 形 状等， Quantification用于引入定量信息， 对特征进行量化衡量， 细化EntityAttribute对 实体的特征的表示， Relationship用于表示实体与实体之间的动态关系， 包括一个组织对 另一个组织的挤压、 侵犯或浸润等； S t e p 1 0 将 S t e p 9 中 的 E n t i t y R e f e r e n c e 分 为 C e l l R e f e r e n c e 、 CellularComponentReferenc e、 SubstanceReferenc e与AnatomicalEntityReference子类， 令CellReference用于表示细胞类型包括淋巴细胞、 红细胞、 纤维细胞、 不同癌症所对应的 肿瘤细胞等； CellularComponentReference用于表示细胞组成结构类型， 包括细胞的细胞 质、 细胞的细胞核等； 令SubstanceReference用于表示细胞的化学物质类型， 包括蛋 白质、 脂肪、 铁血红素等； 令AnatomicalEntityReference用于表示组织或解剖学结构的类型， 包 括毛细血 管、 腔。 4.根据权利要求2所述的一种基于语义网技术的组织病理切片语义描述语言的建立方 法， 其特征在于： 所述 步骤二设置对象属性具体方法为： Step1建立对象属性hasComponent， 规定该对象属性的域和范围为步骤一Step2中设置 的PhysicalEntity本体 类， 表示不同实体间的组分 关系； Step2建立对象属性has_entityReference， 规定该对象属性的域为PhysicalEntity本 体类， 范围为步骤一Step9中的EntityReference本体类； 在PhysicalEntity中使用has_ entityReference， 将属性值设为EntityReference， 表示前者是属于后 者所表示的实体类 型的一个实体； Step3建立对象属性hasAttribute， 规定该对象属性的域为PhysicalEntit y本体类， 范 围为步骤一Step9中的EntityAttrib ute本体类； 在PhysicalEntity中使用hasAttrib ute， 将属性值设为EntityA ttribute， 表示后者是 前者的一个特 征； Step4建立对象属性hasProduct与hasReserve， 规定对象属性的域为PhysicalEntity 本体类， 范围为步骤一Step10中的Substance(SubstanceReference)本体类； 在 PhysicalEntity中使用hasProduct或hasReserve， 将