(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202211367300.4 (22)申请日 2022.11.03 (71)申请人 杭州联川生物技 术股份有限公司 地址 310018 浙江省杭州市杭州经济技 术 开发区6号大街26 0号16幢四层 (72)发明人 陈哲名　郎秋蕾　韩斐然　 (74)专利代理 机构 杭州信与义专利代理有限公 司 33450 专利代理师 万景旺 (51)Int.Cl. G16B 35/00(2019.01) G16B 40/00(2019.01) G06K 9/62(2022.01) (54)发明名称 一种单细胞转录组低质量细胞过滤方法、 介 质和设备 (57)摘要 本发明公开了一种单细胞转录组低质量细 胞过滤方法， 涉及生物数据处理方法。 包括以下 步骤： 对细胞进行分群； 按基因取表达量平均值， 生成细胞群的特征表达谱； 将所述细胞群的特征 表达谱随机两两组合， 生成人工多细胞； 合并所 述人工多细胞表达谱和真实细胞表达谱， 计算每 个细胞间的距离； 在规定范围内设置若干等距的 邻域， 计算每个邻域下， 每个真实细胞在邻域内 的人工多细胞比例； 统计每个邻域下的人工多细 胞比例分布， 求其双峰系数， 并以双峰系数最大 的邻域为最优邻域； 在最优邻域下， 将人工多细 胞比例最大的规定数量的真实细胞认定为多细 胞， 将其从真实细胞表达谱中删除。 提高了单细 胞转录组数据的过滤标准和精 准度， 增强了数据 的可靠性。 权利要求书2页 说明书7页 附图2页 CN 115440303 A 2022.12.06 CN 115440303 A 1.一种单细胞转录组低质量细胞 过滤方法， 其特 征在于， 包括以下步骤： S101， 基于真实细胞表达谱， 对细胞进行分群； S1041， 将每个细胞群的细胞表达谱， 按基因取表达量平均值， 生成每一细胞群的特征 表达谱； S1042， 将所述细胞群的特 征表达谱随机 两两组合， 生成一定数量的人工多细胞； S1043， 合并所述人工多细胞表达谱和真实细胞表达谱， 计算每 个细胞间的距离； S1044， 在规定范围内设置若干等距的邻域， 计算每个邻域下， 每个真实细胞在邻域内 的人工多细胞比例； S1045， 统计每个邻域下的人工多细胞比例 分布， 求其双 峰系数， 并以双 峰系数最大的 邻域为最优邻域； S1046， 在最优邻域下， 将人工多细胞比例最大的规定数量的真实细胞认定为多细胞， 将其从真实细胞表达谱中删除。 2.根据权利要求1所述的一种单细胞转录组低质量细胞过滤方法， 其特征在于， 所述特 征表达谱的两 两组合的方法为： Y=a1*X1+a2*X2 其中， Y为生成的人工多细胞， X1、 X2为细胞群 的特征表达谱； a1、 a2之一设为1， 另一个 设为大于 0小于1的随机值。 3.根据权利要求1所述的一种单细胞转录组低质量细胞过滤方法， 其特征在于， 所述细 胞间的距离为欧氏距离或曼哈顿距离 。 4.根据权利要求1所述的一种单细胞转录组低质量细胞过滤方法， 其特征在于， 所述人 工多细胞比例为： 人工多细胞的数量与合并后的表达谱位于该邻域内的总细胞 数的比值。 5.根据权利要求1所述的一种单细胞转录组低质量细胞过滤方法， 其特征在于， 所述双 峰系数为： 其中， 为双峰系数； 和 分别为人工多细胞比例分布的偏度和峰度； 为真实细 胞数。 6.根据权利要求1所述的一种单细胞转录组低质量细胞过滤方法， 其特征在于， 所述规 定数量的确定方法如下： 设置多细胞率， 以真实细胞数与所述多细胞率的乘积为认定为多 细胞的真实细胞的规定数量。 7.根据权利要求1所述的一种单细胞转录组低质量细胞过滤方法， 其特征在于， 所述 S1044中， 邻域的设置如下： 在0.0 001~0.01范围内设置10 0个等距的邻域。 8.一种计算机存储介质， 其上存储有计算机程序， 其特征在于， 该程序被处理器执行时 实现如权利要求1至7任意 一项所述的单细胞转录组低质量细胞 过滤方法。 9.一种终端设备， 包括存储器、 处理器以及存储在所述存储器上并可在所述处理器上 运行的计算机程序， 其特征在于， 所述处理器执行所述计算机程序时实现如权利要求1至7权　利　要　求　书 1/2 页 2 CN 115440303 A 2任意一项所述的单细胞转录组低质量细胞 过滤方法。权　利　要　求　书 2/2 页 3 CN 115440303 A 3