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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210162686.9 (22)申请日 2022.02.22 (71)申请人 天津见康华美医学诊断技 术有限公 司 地址 300380 天津市西青区西青经济技 术 开发区兴华三支路5号赛达检测认证 园A2座101b号厂房 (72)发明人 汝昆 蔺亚妮 陈龙 王雪 (74)专利代理 机构 北京精金石知识产权代理有 限公司 1 1470 专利代理师 陈伟 (51)Int.Cl. C12Q 1/6886(2018.01) C12Q 1/6869(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种急性髓系白血病检测探针组合物及其 应用 (57)摘要 本发明属于分子生物学技术领域, 具体涉及 一种急性髓系白血病检测探针组合物及其应用。 采用本发明提供的探针组合物检测急性髓系白 血病, 具有较好的灵敏度和准确度, 扩增效率高, 且操作简便, 快速省时, 可 以实现在骨髓形态学 和血常规检查之外对AML进行辅助诊断, 特别是 对于疾病后续的治疗方向和效果做出预判具有 特殊的优势, 可弥补临床AML在分子诊断、 疾病演 变、 治疗、 预后、 用药等指导方面的不足。 权利要求书1页 说明书19页 序列表97页 附图2页 CN 115323051 A 2022.11.11 CN 115323051 A 1.一种急性髓系白血病相关基因群检测的探针组合物, 其特征在于: 所述的探针组合 物包括SEQ ID NO:1‑SEQ ID NO:538所示的序列。 2.权利要求1所述的探针组合物在制备急性髓系白血病相关基因群检测产品中的应 用。 3.一种急性髓系白血病相关基因群检测的产品, 其特征在于: 所述的产品包括权利要 求1所述的探针组合物。 4.根据权利要求3所述的产品, 其特 征在于: 所述的产品包括独立试剂、 芯片或试剂盒。 5.权利要求1所述的探针组合物或权利要求3 ‑4任一项所述的产品在检测急性髓系白 血病相关基因群突变中的应用。 6.一种检测急性髓系白血病相关基因群突变的方法, 所述的方法为非疾病诊断和治疗 方法, 其特征在于: 所述的方法包括利用权利要求1所述的探针组合物或权利要求3 ‑4任一 项所述的产品对待测样本中急性髓系白血病相关基因群的突变进行检测。 7.根据权利要求6所述的方法, 其特 征在于: 所述的方法包括以下步骤: (1)血液样本单个核细胞分离; (2)样本DNA提取; (3)文库构建; (4)上机测序; (5)数据分析。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 115323051 A 2一种急性髓系白血病检测探针组合物及其应用 技术领域 [0001]本发明属于分子生物学技术领域, 具体涉及一种急性髓系白血病检测探针 组合物 及其应用。 背景技术 [0002]急性髓系白血病(acute myeloid leukemia, AML)是一组异质性的侵袭性血液系 统恶性肿瘤, 其临床病程和治疗反应存在广泛差异。 急性髓系白血病的特征是未成熟 的骨 髓前体的扩张, 从而导致正常的造血功能受损, 最终导致骨髓衰竭。 它是由影响造血干细胞 或祖细胞增殖和/或分化的遗传改变的逐步积累引起的。 AML在发生时常伴随着高度 异质的 细胞遗传学和分子生物学异常, 这些异常能够辅助诊断、 评估预后, 从而参与治疗 决策。 近 年来, 测序技术的进步使得急性髓系白血病(AML)复发突变的鉴定成为可能。 通过AML的测 序工作, 一个广泛的体细胞突变目录逐步呈现出来。 其中反复发生的突变显示出高度的重 叠, 而频率较低的突变则高度分化。 这表明, 反复发生的突变是导致疾病的真正致癌驱动突 变, 而低频突变则可能是不影响AML 生物学的无关突变。 [0003]人类AML患者中发现的最常见的异常之一是在正常造血发育过程中起作用的转录 因子和表观遗传调节因子的突变, 包括融合蛋白(如: PML ‑RARa、 RUNX1 ‑RUNX1T1、 CBFb ‑ MYH11等)和AML相关基因的重要突变(如: TP53、 CEBPA、 FLT3、 DNMT3A等)等。 如, 专利 CN107964561A公开了检测CEBPA 基因突变的引物及检测方法, 进一步用于判断正常核型AML 患者的预后情况, 用于检测的准确度、 特异性和灵敏度较高。 专利CN 108929912A则公开了一 种用于筛查急性髓系白血病的引物、 试剂盒以及方法, 其包括用于扩增人CCN1基因的SNP位 点rs2297141和rs6576776片段的引物 组合物, 通过对位点rs2297141, rs6576776单个核酸 多态性检测与分析, 实现汉族人群急性髓系白血病的早期 筛查和易感性的风险评估。 然而, 现有的这些评估标志物并不能完全有效地预测AML患者的风险, 原因如下: 第一, 约50%的 AML患者核 型正常, 既无基因组结构变异 也无已知的基因突变, 这些患者的复发风险和生存 时间用现有的标志物难以预测。 第二, 虽然有些基因突变对生存时间的分类效果在统计学 上极其显著, 但是这些基因的突变率极低, 绝大部 分患者中无该类基因的突变, 因此无法根 据基因突变预测这些患者的生存时间。 第三, 现有的评估 标准(如: European Leukemia Net guideline)通常将患者归为高、 中、 低风险三类, 绝大部分患者被归为中风险类, 进而采用 相似的治疗手段。 然而, 被归类为中风险类的患者对于联合化疗的治疗反应有好有坏, 这表 明, 对于中风险类的患者, 还应使用新的预后标志物进行细分, 进而调整治疗方案, 以达到 更好的治疗效果。 第四, 不同的基因突变间往往存在 共现或互斥的情况, 因此很多现有的预 测因子没有独立的预后效果。 比如, NPM1突变且FLT3不 突变的患者具有较好的预后。 [0004]因此, 亟需提供一种 急性髓系白血病检测灵敏度、 准确度更高的探针组合物及其 检测方法。说 明 书 1/19 页 3 CN 115323051 A 3
专利 一种急性髓系白血病检测探针组合物及其应用
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