(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210266693.3 (22)申请日 2022.03.17 (71)申请人 江苏省人民医院 （南京医科 大学第 一附属医院） 地址 210029 江苏省南京市广州路3 00号 (72)发明人 杨涛　徐宽枫　张杰　顾愹　陈阳　 施云　 (74)专利代理 机构 南京苏科专利代理有限责任 公司 32102 代理人 徐振兴 (51)Int.Cl. C12Q 1/6883(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 基于22个SNP易感位点评估1型糖尿病患病 风险的试剂盒 (57)摘要 本发明公开了22种 与1型糖尿病患病风险辅 助诊断相关的SNP标志物， 并研制出可便于临床 应用的1型糖尿病辅助诊断试剂盒， 为发现具有 潜在治疗价值的新型小分子药物提供 数据支持。 权利要求书3页 说明书9页 序列表7页 附图1页 CN 114427002 A 2022.05.03 CN 114427002 A 1.22种与  1 型糖尿病患病风险辅助诊断相关的  SNP 标志物， 其特征在于： 该SNP  标 志物为： RGS1基因附近rs2816313位点， 序列为ACCCTTTGAGCTGAGTCTGGAGCCAGAGCT[G/A] CCAGGATGCAGACAGCAGTGTCCTGAGGCT； AFF3基因附近rs12712067位点， 序列为 TCCCCATTGAGCAAAGGGACAGCTAAGGTG[G/T]TAGTGGGTGAGGGAGTACTGGTTAGAACTG； ACOXL基因上 rs4849135位点 ， 序列为ACTTTATTACCAAGGATGGGAGGAAGAGGG[T/G] TTGGGCCAACAACTGGAAATCTTGCTACAC； IFIH1基因附近rs2111485位点， 序列为 CACCAGCATGGGGTCATAAATATAAAGCCT[A/G]GAAGGGTGGAATTTCCCTGAGGAAGAAGAA； S TAT4基因上 rs7582694位点 ， 序列为CACACCAAATTCATGAAGGGATGACACATA[C/G] AGTATGCAACCTATGCATGTTTGCTTGTTC； CTLA4基因附近rs3087243位点， 序列为 TGATTTCTTCACCACTATTTGGGATATAAC[G/A]TGGGTTAACACAGACATAGCAGTCCTTTAT； RING1基因附 近rs62405743位点， 序列为CCAGCACTTTGGGAGGCTAAGGCCAATGGG[T/C] TACTTGAGGCCAGGAGTTCGAAACCAGCCT； BACH2基因上rs9294458位点， 序列为 GCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAA[G/C]ATTACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCAT； AHI1基 因上 rs2179781位点 ， 序列为CCAGGACAGAGAAGTGAAGGATTTGGAAGA[C/A] AACACTGTAACTGTTAAAGAAAAATTTCTA； GRB10基因上rs735048位点， 序列为 CCCAGACAAGAGACTGGAACTCAGTTCAAT[A/G]GGACGTTTCCCAAAGCGGCTAGGAGCTGAT； TNFRSF11B基 因附近rs4355801位点， 序列为AGCAGTAAACAGGTGTACAGGTCTCAATAA[A/G] TGGGTGGTAGGTGTCAGGGAAAGTCAGCTG； GLIS3基因上rs1574285位点， 序列为 ACACACACACACACAGGAATGCACTTTGCA[G/T]GATTGCAAAGCTAGCTCTTTACCTTCCAAG； GATA3基因上 rs3802604位点 ， 序列为CCTGCATGTTCAGTACATGAAAGTAGGCAG[G/A] AGGGAGAGGGAGGCAGGCTAGCTGGTGGAG； RNLS基因上rs2018705位点， 序列为 TTAGTTCATTCTCA CACTGCTATTAAGAA C[T/A]TCCCTGAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAA； INS基因附近 rs3842752位点 ， 序列为GCAGGAGGCGGCGGGTGTGGGGCTGCCTGC[G/A] GGCTGCGTCTAGTTGCAGTAGTTCTCCAGC； SLC1A2基因上rs17378105位点， 序列为 AGGAGATCCACGTAAGCATTGGCTAAGAGC[G/C]TGAAGTCCGGATACCAGCCTGGATGACACT； RPS26基因附 近rs34415530位点， 序列为ATTTTTTCTTCAATAATAAATTAACCTTAG[C/T] TTACTGTAACTTTTTTTTTCTTTCTTTTTT； ZFP36L1基因上rs927292位点， 序列为 ACTGGCTGACAAGCAACATGTTTTAA GGAG[C/G]CCCCCATTAAATCCTTACTCGCGGGACTCT； VRK1基 因附 近rs4900384位点 ， 序列为TAGGACACTTCTGTTTTAATCTCATGGACC[A/G] GAATGTAGTCACATAACCACATCCAGCTGT； IL2RA基因附近rs12928537位点， 序列为 TTCCTTCTTTACCTGAATCATTAATGGCAA[G/A]GAGCACCGACACAGAACTGAGTTCAGGGCT； SMARCE1基因 附近rs8066541位点， 序列为CAGGCTGGTCTTGAACTTCTGAACACAAGC[G/A] ATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTG； HORMAD2基因上rs193477位点， 序列为 AATGCCTGTAGTC CTAGCTACT TGTGAGGC[C/T]GAGGGAGGAGAATCGCTTGAGCCCAGGAGT的组合。 2.用于扩增权利要求  1 所述的 SNP 标志物的引物组合， 其特征在于： 该引物组合包 括特异性扩增引物， 所述引物具体为： 所述 rs2816313  位点为： 以人基因组  DNA 为模板， 采用引物对  1 进行 PCR 扩增得 到的扩增产物； 所述 位点的核苷酸 为 G 或 A； 所述 rs12712067  位点为： 以人基因组  DNA 为模板， 采用引物对  2 进行 PCR 扩增得权　利　要　求　书 1/3 页 2 CN 114427002 A 2到的扩增产物； 所述 位点的核苷酸 为 G 或 T； 所述 rs4849135  位点为： 以人基因组  DNA 为模板， 采用引物对  3 进行 PCR 扩增得 到的扩增产物； 所述 位点的核苷酸 为 T 或 G； 所述 rs2111485  位点为： 以人基因组  DNA 为模板， 采用引物对  4 进行 PCR 扩增得 到的扩增产物； 所述 位点的核苷酸 为 A 或 G； 所述 rs7582694  位点为： 以人基因组  DNA 为模板， 采用引物对  5 进行 PCR 扩增得 到的扩增产物； 所述 位点的核苷酸 为 C 或 G； 所述 rs3087243  位点为： 以人基因组  DNA 为模板， 采用引物对  6 进行 PCR 扩增得 到的扩增产物； 所述 位点的核苷酸 为 G 或 A； 所述 rs62405743  位点为： 以人基因组  DNA 为模板， 采用引物对  7 进行 PCR 扩增得 到的扩增产物； 所述 位点的核苷酸 为 T 或 C； 所述 rs9294458  位点为： 以人基因组  DNA 为模板， 采用引物对  8 进行 PCR 扩增得 到的扩增产物； 所述 位点的核苷酸 为 G 或 A； 所述 rs2179781  位点为： 以人基因组  DNA 为模板， 采用引物对  9 进行 PCR 扩增得 到的扩增产物； 所述 位点的核苷酸 为 C 或 A； 所述 rs735048  位点为： 以人基因组  DNA 为模板， 采用引物对  10 进行 PCR 扩增得 到的扩增产物； 所述 位点的核苷酸 为 A 或 C； 所述 rs4355801  位点为： 以人基因组  DNA 为模板， 采用引物对  11 进行 PCR 扩增得 到的扩增产物； 所述 位点的核苷酸 为 A 或 G； 所述 rs1574285  位点为： 以人基因组  DNA 为模板， 采用引物对  12 进行 PCR 扩增得 到的扩增产物； 所述 位点的核苷酸 为 G 或 T； 所述 rs3802604  位点为： 以人基因组  DNA 为模板， 采用引物对  13 进行 PCR 扩增得 到的扩增产物； 所述 位点的核苷酸 为 G 或 T； 所述 rs2018705 位点为： 以人基因组  DNA 为模板， 采用引物对  14 进行 PCR 扩增得 到的扩增产物； 所述 位点的核苷酸 为 T 或 G； 所述 rs3842752  位点为： 以人基因组  DNA 为模板， 采用引物对  15 进行 PCR 扩增得 到的扩增产物； 所述 位点的核苷酸 为 G 或 A； 所述 rs17378105  位点为： 以人基因组  DNA 为模板， 采用引物对  16 进