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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210272056.7 (22)申请日 2022.03.18 (71)申请人 湖南农业大 学 地址 410128 湖南省长 沙市芙蓉区农大路1 号 (72)发明人 朱俊子 钟杰 李晓刚 马雅敏 (74)专利代理 机构 四川云首创专利代理事务所 (普通合伙) 51359 专利代理师 万利 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12Q 1/6844(2018.01) C12N 15/11(2006.01) C12R 1/77(2006.01) (54)发明名称 一种叶斑菌病原菌LAMP检测引物、 试剂盒及 LAMP快速 检测方法 (57)摘要 本发明提供一种叶斑病病原菌的LAMP检测 引物, 涉及植物病原菌检测的技术领域, 所述引 物包括正向外引物F3、 反向外引物B3、 正向内引 物FIP和反向内引物BIP, 所述引物系列如下: F3: 5’‑ACCAGTGCGGTGGTATCG ‑3’; B3: 5’‑ CAAGAGCGCCTGTCACTC ‑3’; FIP : 5 ’‑ G G A T C G A T G G G A A G A A G G G C G C A A G C G A A C C A T C G A G A A G T ‑3’; B I P : 5 ’‑ CATACGACGACTCGACAAGCGCCCACCACCCAAAAAAACGA C‑3’。 权利要求书2页 说明书6页 序列表1页 附图4页 CN 114480722 A 2022.05.13 CN 114480722 A 1.一种叶斑病 病原菌的LAMP检测引物, 其特 征在于: 所述引物包括正向外引物F3、 反向外引物B3、 正向内引物FIP和反向内引物BIP, 所述引 物系列如下: F3: 5’ ‑ACCAGTGCGGTGGTATCG‑3’; B3: 5’ ‑CAAGAGCGCCTGTCACTC ‑3’; FIP: 5’ ‑GGATCGATG GGAAGAAGGGCGCAAGCGAACCATCGAGA AGT‑3’; BIP: 5’ ‑CATACGACGACTCGACA AGCGCCCACCACCCAAAAAAACGAC‑3’。 2.一种叶斑病 病原菌的LAMP检测试剂盒, 其特 征在于, 包括权利要求1所述的引物。 3.根据权利要求2所述的叶斑病病原菌的LAMP检测试剂 盒, 其特征在于: 试剂盒还包括 dNTPs、 Bst DNA聚合酶、 10 ×isothermal amplificationbuffer和MgSO4。 4.一种包 含权利要求1所述引物的叶斑病 病原菌的LAMP检测反应 体系, 其特 征在于: 反应体系包括: 10uM的FIP和BIP引物各4μL, 10uM F3和B3引物各0.5μL, 10mM dNTPs 2.5 μL, 8U/ μL Bst DNA聚合酶1 μL, 50mM MgSO44 μL, 10×isothermal amplificationbuffer 2.5 μL, 用灭菌超纯 水补平至25 μL。 5.一种基于权利要求4所述反应体系的叶斑病病原菌的LAMP检测方法, 其特征在于, 包 括以下步骤: S1: 获取叶斑病 病原菌的EF ‑1α 基因保守区利用Primer Explore V5在线设计引物; S2: 制备25 μL的权利要求 4中的检测反应 体系; S3: 将待测样品总DNA于S2所述的检测 反应体系中进行LAMP扩增, 反应结束后, 取反应 产物; S4: 将反应产物用琼脂糖凝胶电泳检测; 或/和用SYBR GreenI染料观察LAMP反应液变 化; S5: LAMP反应产物在琼脂糖凝胶电泳出现连续呈弥散状条带为阳性, 存在叶斑菌病原 菌; 和/或反应液呈现翠绿色为阳性, 存在叶斑病病原菌, 淡橙色为阴性, 不存在叶斑病病原 菌。 6.根据权利要求5所述的LAMP检测方法, 其特征在于, 所述反应体系中的反应条件为: 温度为60℃、 反应时间为6 0min。 7.根据权利要求5所述的LAMP检测方法, 其特 征在于, 所述S1中获取叶斑病 病原菌的操作步骤如下: 步骤一: 剪取罹病叶片病健交界部分的组织进行消毒, 再用无菌水漂洗, 用无菌滤纸吸 干水分后将其 放置于含有链霉素的P DA平板上, 26℃黑暗培 养; 步骤二: 将长出的菌落转接至PDA培养基, 通过单孢分离进行纯化后用PDA斜面保存于4 ℃备用, 得到分离纯化的菌株。 8.根据权利要求7所述的LAMP检测方法, 其特征在于, 还包括对叶斑病病原菌的鉴定, 包括以下步骤: Sa: 将分离纯化的菌株接种于P DA培养基中培 养出菌丝, 然后提取真菌DNA; Sb: 通过引物ITS4/ITS5和EF1 ‑728F/EF1‑986R扩增核糖体转录间区和翻译延长因子基 因部分序列; Sc: 构建PCR反应体系, 该PCR反应体系为2 ×Es Taq Master Mix25 μL、 总DNA模板2 μL、权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 114480722 A 210 μM上下游引物各2 μL、 d dH2O 19 μL, 扩展反应取反应产物; Sd: 反应产物经琼脂糖凝胶电泳检测后, 进行序列测定, 获序列在NCBI数据库进行 BLASTN比对分析, 利用M EGA6软件中邻接法构建系统发育树。 9.根据权利要求8所述的LAMP检测方法, 其特征在于, PCR反应条件94℃预变性5min; 94 ℃变性30s, 56℃退火3 0s, 72℃延伸1mi n, 共35个循环; 最后72℃延伸10mi n, 4℃保存。 10.根据权利要求2所述的试剂 盒在植物叶斑菌病原菌鉴定中的应用, 所述植物为黄花 菜。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 114480722 A 3
专利 一种叶斑菌病原菌LAMP检测引物、试剂盒及LAMP快速检测方法
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